根据2003年8月卫生部曾颁发的《中国流行性感冒疫苗预防接种指导意见（试行）》通知精神，每年9－11月是流感疫苗的接种时间。流感接种的最佳时间是在流感流行高峰前1-2个月接种，疫苗能更有效发挥保护作用。但这并不是说在流感流行之后就不能接种流感疫苗，疫苗接种后2个星期左右便可发挥作用，所以即便在流感流行期，人们还可以接种流感疫苗。

由于接种疫苗后人体内产生的抗体水平会随着时间的延续而下降，并且每年疫苗所含毒株成分因流行优势株不同而有所变化，所以每年都需要接种当年度的流感疫苗。