本草物质组计划打算把现代化带到一个全新的水平。这项计划是梁鑫淼首先提出的，他相信许多中药是有效的。“问题是我们不知道它为什么有效，”他说。主要的障碍是药方很复杂。做为一个例子，梁鑫淼展示了一种用以外涂消除肌肉疼痛的药方“红花油”的色谱图。梁鑫淼说，在化学家处理的许多样品中，一个峰通常代表一种化合物。但是对红花油来说，一个峰是许多化合物，将之分馏产生了更多的多化合物峰，就像俄罗斯套偶。梁鑫淼说，红花油至少由1万种化合物组成：“我们只知道100种。”

　　面对这种复杂性，“我们必须发明新的方法学，”梁鑫淼说。“这是本草物质组计划的战场。”首先，他在大连化学物理研究所的45人团队正在研发新的分离介质。草药将被分解成“多组分”：相似的成分为一组。为了确定哪种物质是有益的或有毒性的，他的研究组计划设计本草组芯片，其中的化合物将根据它们与关键多肽的结合能力进行筛选。扩大后的本草物质组计划将会有国内外许多研究机构的人员参与。

　　本草物质组计划有隐藏的危险性。其中之一是担心西方制药公司会通过改造该计划鉴定出的化合物研发出销量巨大的药物，掠走战利品。为了对抗这种可能性，果德安说：“我们鼓励科学家不要急于发表论文，并先（对鉴定出的候选药物）做结构改造。”然后团队会对一组相似结构的化合物申请专利。

　　并不是所有的中医业者都接受对中医药去神秘化。“有些人担心传统会丧失掉，”陈凯先说。但是惠永正说“为了调和西医知识导向的演绎法和中医经验导向的归纳法”，现代化是必要的。方舟子另有看法：“你能够结合占星术和天文学，炼金术和化学吗？它从来就行不通。”

　　惠永正坚持认为中医能与西医共处。梁鑫淼希望他的本草物质组计划将会证明惠永正是对的。（美国《科学》2008年2月8日）