为了反击中药的批评者，本草物质组计划将采用高通量筛选、毒性检验和临床试验以鉴定出常用药方中的活性成分和毒性污染物。“我们需要确保中药是安全的，并且显示它不止是青蒿素，”在上海药物所负责中医药现代化项目但未参与本草物质组计划的果德安说。最初的目标是癌症，肝脏和肾脏疾病，以及用西药难以治疗的其他疾病，例如糖尿病和抑郁症。

　　中国科学院最大和科研资金最充足的研究所之一——大连化学物理研究所获得了一笔5百万美元的启动基金用以研发纯化方法；科技部正在审核这个计划，打算把它划入自2010年开始的下个5年计划的一项7千5百万美元的创新规划中。今年春天北京香山会议——相当于中国的戈登学术会议——将为此举行一个规划会议。

　　中药界的几名权势人物已支持这项规划。“开始这个项目正是时候，”上海中医药大学校长、化学家陈凯先说。上海中药创新研究中心理事长惠永正说，制药公司应该会对本草物质组计划感兴趣，因为它能够鉴定出许多候选药物。

　　在世界上许多地方，传统医学药方是通过口述代代相传的。但是在中国，2千多年前的医生已开始编写药典。虽然在大城市西医已大体上取代了中医，但是许多中国人仍然相信中医药做为预防药物和治疗慢性病很有效，而在乡村的中国人还在依赖它。“我们大多数人在感到身体不适时，就吃中药，”大连化学物理研究所的梁鑫淼说。

　　自从毛泽东时代以来，中国政府就在强烈支持中医药，部分原因是因为没钱向大众提供西医药。中国媒体至今还忌讳把中医称为伪科学。“对许多中国人来说，批评中医药是无法想像的，几乎就像是犯了叛国罪，”方舟子说。

　　支持者坚持认为中医药可以提供很多东西。但是伴随着每一项中药成功的宣称，都有不良反应的报告，有的来自天然毒性成分，有的来自杀虫剂之类的污染物。中药剂量也难以确定，因为药方的效力根据草药产地和采集时间而发生变化。不同的厂家和不同的批次的药物质量能够出现差异。“这就是为什么许多人不信任中药，”果德安说。在中药现代化进程时，质量控制是一个首要关注的问题。